此次上实系的整合预期源自于去年7月，在上实医药实际控制人获得上药集团60%股权后，上药集团与上实医药构成了同业竞争，其中包括上药集团母体主营医药工业业务(包括抗生素、处方药、非处方药和原料药在内的大量未上市资产)，以及经营医药分销的600849 上海医药和医药制剂业务的600842 中西药业。因此，上实系的新一轮资产整合预期由此展开。
根据上实医药此前的公告，或通过吸收合并，或将相关上市公司按工业制造和分销零售专业分工，形成经营特点。最迟于2009年6月30日前，提出消除同业竞争的方案。与此同时，上实医药董事长吕明方在今年4月股东大会上也表示，正常情况下，上药集团重组的初步方案将在6月底出台。
联合证券研究员谷方庆认为，由于重组方案涉及浙江、福建等多省的行政审批，程序繁琐而导致资产重组方案一度在2008年9月宣布暂时失败，而后更由于上海医药大股东身份的变换涉及同业竞争等问题，资产整合变得更为复杂，公司的资产重组实质上已经变更为上实医药、上海医药、中西药业之间业务结构如何调整的问题。
对于上实系医药资产的整合思路，业内的看法较一致，大致为：上海医药继续发展分销零售的优势；上药集团未上市的医药制造业注入上实医药；中西药业由于本身盈利能力不强，实质资产不多，未来最有可能的是通过重组的方式被剥离。
“由于上实医药已经明确宣布最迟6月底推出重组方案，我们也预期公司将继续成为上海国资委对医药工业整合的平台。”谷方庆称。
尽管整合方案仍在商榷，但从上实集团此前的资产运作来看，上实集团对上实医药的战略定位似乎比较明确，即逐步将上实医药打造成为集团的医药产业平台。为此，2007年5月，上实医药计划募资15.15亿元用于收购大股东持有的青春宝药业55%股权、杭州胡庆余堂药业51%股权及厦门中药厂61%股权等。但是，上述收购协议因未能在规定期限内完成全部的环保审核而自动终止。
即便如此，上实集团似乎仍没有放弃打造上实医药成医药工业的决心。今年1月，上实医药公告称，将出售上实商务网络（参股联华超市），此次交易完成后，上实医药退出联华超市，这更加清晰了公司医药产业的投资方向，此次获得的5.48亿元收益也将用于医药业务投资和发展。这也似乎可以说明，上实医药作为上实集团医药工业资产整合的平台方向比较明确。
值得注意的是，不知是受强烈的整合预期还是限售股解禁所致，昨日，上实医药、上海医药及中西药业三家公司股价均呈现冲高态势，上实医药更是一度冲击涨停。
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